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基于显微切割 一质谱联用的空间代谢组学方法表征肿瘤微环境异质性
高天龙，钟晨春，龙志敏，郭立海
徕卡生命科学:2SCIEX中国,应用支持中心
肿瘤的发展与肿瘤微环境息息相关。在癌症发生中,正常组织中和谐的细胞相互作用关系被破坏,逐渐演变成适应肿瘤生长的条件。肿瘤微环境的变化,可能导致不同细胞区室的基因、蛋白表达及信号通路的改变。针对肿瘤微环境的检测和表征研究可为癌症治疗提供新的思路。
传统分析技术受取样精确度以及分析灵敏度的限制,无法精准获取靶向部位,而对其中特异代谢物的差异表征就更加困难。激光显微切割技术可以方便地对特定的组织区域精确分离。结合高灵敏度的液质联用检测技术,从而将空间定位准确的微区细胞代谢谱进行全面准确的表征。
本次课程来源于分析测试百科网联合徕卡举办的网络会议《类器官技术在肿瘤研究中的应用与展望》，简介如下：
如何实现类器官稳定培养和低光毒性连续成像，如何在一台设备上实现类器官长时间培养和原位共聚焦高分辨采集，如何评价类器官不同细胞分化潜力和细胞的代谢活性，类器官是否能无标记成像，采集数据如何快速分割分析；徕卡带您了解最新的显微成像技术及人工智能分析平台在类器官研究中的应用。
为帮助相关领域的用户了解生物成像前沿技术及应用进展，仪器信息网将于2023年04月18日举办“生物成像技术在肿瘤诊断与治疗中的应用”主题网络研讨会，本届网络研讨会为期1天，徕卡受邀带来精彩报告《肿瘤诊断与治疗中的免疫荧光显微成像》。
本次课程简介：癌症由于其高发性和高死亡率是当今医学领域研究的重中之重。随着科学技术的不断发展，从原来的病理诊断，通过HE染色，显微成像进行肿瘤诊断，逐步发展到荧光成像。荧光素的标记，让我们可以通过区分开更多的生物标志物，来进行更加精准的诊断，研究个性化的免疫疗法。
常用的数据分析包括计数、定位、共定位、荧光强度、体积、面积、表面积、周长、直径等数据的测量。
经典的图像分析流程可以概括为：图像导入分析软件 → 分割结构信号 → 得到统计数据
实际的图像分析流程往往包括：图像导入分析软件 → 图像预处理 → 分割结构信号 → 批量分析 → 分割结果后处理→ 得到统计数据 → 识别感兴趣结构
这些步骤不仅增加了数据分析的工作量，也成为了图像分析初学者的入门障碍——繁多的预处理滤镜选项不仅要求使用者掌握大量的背景知识，其搭配组合的选择也要求使用者熟知各种滤镜的参数调节和效果，以获得预期的结果。
在本期网络课堂中，我们将从图像导入到结果输出，更全面地了解数据分析流程，其中多种可能性及人工智能工具的应对方法。
肿瘤复杂机制的研究与新疗法新药物的开发给肿瘤的显微成像技术提出了非常高的要求。研究对象涵盖从肿瘤细胞内的蛋白分子及信号通路、细胞间相互作用、肿瘤组织及微环境，到整体动物肿瘤的转移及肿瘤活性物质的运输。研究维度从静态到活体动态、从形态到功能成像等等。针对成像的难点和挑战，Leica给出了多种成熟的肿瘤成像方案。
抽丝剥茧，超多重免疫标记解密肿瘤微环境之奥秘”。徕卡生命科学部的高级应用专员刘继红和Cell DIVE应用科学家Michael Smith为广大观众揭示了CELL DIVE 超多重标记解决方案如何轻松应对复杂的肿瘤微环境，为临床肿瘤的研究和治疗提供了优秀的研究工具。
Indica Labs应用科学家赵永田重点介绍了在HALO中对获取的Cell DIVE图像的处理、分析步骤以及如何进行高纬的空间生物学分析，用以了解肿瘤微环境中肿瘤细胞和免疫细胞的相互作用关系对研究肿瘤免疫应答的作用机制。
