微信扫码或点击右上角...分享

基于激光显微切割-液质联用技术的微量细胞广靶脂质组学分析

活细胞无时不在与外界进行着物质和能量的交换,其代谢水平应是其生命体征的主要表现。在健康和疾病中,代谢程序和它们所支持的特定生理功能之间有着密切的联系。这些核心代谢功能的失调与许多现代疾病有关。由于每个细胞都生活在一个独特的环境中,我们体内没有一个细胞在新陈代谢、表型和功能上完全相同。在单细胞分辨率下,解决代谢的时空异质性将推动代谢领域向前发展,并转换到临床应用和理解体内系统代谢组学变化的基础。

提交后,我们将每月自动将您关注领域的行业快讯更新链接通过短信、邮件发送给你

相比DNA和RNA,细胞内的代谢物无法扩增,单个细胞能够提供的用于分析的代谢物浓度低体积小,对分析设备和方法的要求较高。因此,本次研究将具有单细胞取样精度的激光显微切割 (LMD, Laser Microdissection)技术和SCIEX 7500高灵敏度质谱系统联合使用,测试在能够用于有效分析的细胞数量。

实验设计

样品制备:脑组织做冰冻切片,样本置于激光显微切割载物台;接收端放置PCR管用于分离体的接收。选择合适的细胞数目或切割面积 (如 ~2000 μm2),在调节好相关参数(Power 49、Aperture 5、Speed 13、Bridge size 4)后开始进行切割(图1)。切割完成后,小心将PCR管取出,由管底倒扣至管盖盖紧,防止管盖中收集的样品遗落。

图1. 脑组织切片样本用于激光显微切割分离体制备。在40倍放大视野中选取合适的面积,约2000 μm2(左)进行切割分离并用于后续分析;一份样品切割分离完成后(右),可继续选择其他区域进行操作。

样品提取:装有样品的PCR管在vortex中振荡5s,由点甩小型离心机将微量样品离心至管底,小心打开管盖,加入30 μL提取溶液(异丙醇:乙腈:水 30:65:5 v/v/v),振荡混匀,超声15 min,离心后将全部溶液转移至进样小瓶中待LC-MS/MS分析。LC-MS条件:样品通过ExionLC™系统串联SCIEX 7500系统,进行分析。数据通过SCIEX OS 软件2.1中的定量功能进行处理。

分析结果

在分离的微量细胞中(组织切片约2000 μm2),共检测到285个脂质化合物,包括鞘脂SM、胆固醇酯CE、甘油三酯TAG、甘油二酯DAG、磷脂酰乙醇胺PE、磷脂酰胆碱PC、神经酰胺Cer7类

图2微量脑组织切片中测得的不同种类脂质化合物的数量。基于LC-MS/MS 的靶向脂质组学方法快速分析基质中的多种脂类物质。

图3对于微量细胞中检测到的脂质化合物的判定,主要基于与空白提取溶剂(阴性对照)和血浆脂质提取样本(阳性对照)共同比较,并且结合各类脂质标准品出峰位置情况、同类脂质化合物有较为接近的出峰位置,而同类脂质化合物连接脂肪酸链越长保留时间越靠后、连接相同碳数的脂肪酸链上不饱和键数越多保留时间越靠前的规律,对微量样本中检出的脂质化合物做定性判断。

通过徕卡激光切割显微镜LMD7获取微量样本技术与SCIEX 7500 系统高灵敏度检测相结合,实现微量细胞高覆盖靶向脂质组学 PE (P-18:0_18:0) 分析检测。在约2000 μm2 组织切片样品中检测到脂质化合物数目285个,符合组学分析对化合物覆盖度的需求。



基于激光显微切割-液质联用技术的微量细胞广靶脂质组学分析 立即观看
RELATED PRODUCTS
相关产品
与传统激光显微切割系统不同,徕卡激光显微切割系统无需移动样品,而是通过移动激光、重力收集,大限度地避免样品污染,为您提供可即时分析的理想切割组织样品。 激光显微切割 (LMD,亦被称为激光捕获显微切割或LCM) 便于用户分离特定的单个细胞或整个组织区域。徕卡激光显微切割系统采用独特的激光设计和易用的动态软件,从整个组织区域到单个细胞,用户可以轻松分离目标区域(ROI)。 激光显微切割通常用于基因组学(DNA)、转录物组学(mRNA、miRNA)、蛋白质组学、代谢物组学,甚至下一代测序(NGS)。神经学、癌症研究、植物分析、法医学或气候研究人员均借助这种显微切割技术进行学科研究。此外,激光显微切割也是活细胞培养 (LCC) 的一款理想工具,可用于克隆、再培养、操作或下游分析。
RELATED DATA
相关资料
2024年10月17日 10:42
活细胞无时不在与外界进行着物质和能量的交换,其代谢水平应是其生命体征的主要表现。在健康和疾病中,代谢程序和它们所支持的特定生理功能之间有着密切的联系。这些核心代谢功能的失调与许多现代疾病有关,包括癌症和慢性炎症性代谢疾病,如糖尿病、肥胖、动脉粥样硬化和类风湿关节炎。然而,由于疾病的复杂性和所涉及的细胞表型甚多,对于发生在致病环境中的代谢重塑的详细了解还很缺乏。营养水平的改变、供能系统的变化以及信号因子的存在以及与邻近细胞的相互干扰,都会诱导代谢变化,使细胞在其特定的组织微环境中发挥作用。由于每个细胞都生活在一个独特的环境中,我们体内没有一个细胞在新陈代谢、表型和功能上完全相同。在单细胞分辨率下,解决代谢的时空异质性和阐明这一复杂性将推动代谢领域向前发展,允许转换到临床应用和理解体内系统代谢组学变化的基础。
2024年02月23日 17:00
观察并从异质起始材料中获得特异和均匀的单一样品,通过重力确保无接触和无污染操作。Leica LMD6/7系统结合了高端全自动正置研究级显微镜和紫外线激光器,并由此确保了出色和准的切割效果。
RELATED TECHNOLOGY
相关技术前沿
2021年11月26日 15:04
生物标记物可用作特定疾病如癌症的指征标记。这样一来,肿瘤微环境就容易引起人们的警觉。但在肿瘤区域和非肿瘤区域以及肿瘤本身之间存在着明显的分子差异。这些情况只能通过分离这些区域的特定的、微小的部分来破译。
2021年11月24日 10:06
激光显微切割是1990年代发展起来的一项较新技术,让人们从非均质原料中获得均质、超纯样品成为了可能。研究人员可以选择性地、常规地分析感兴趣的区域,直至单个细胞,以获得可重复的、特异的结果。如今,这项技术被广泛应用于许多研究领域,如神经学、癌症研究、植物分析等。在这里,用户报告自己通过激光显微切割所取得的研究成果。
2020年09月28日 20:13
病毒学中荧光显微镜可以更好地满足研究人员对冠状病毒研究的需求。然而,在对动物组织进行研究时,仍有机会进行明场显微镜检查,比如检查病毒感染后组织的形态变化等。此外,在细胞培养实验室中使用明视野显微镜检查已经感染或将会感染的细胞(DM IL,DMi1,PAULA)的健康状况和生长状态。
RELATED ONLINE WEBINARS
网络课堂
2023年08月18日 16:41

本次课程来源于网络研讨会《植物单细胞组学中的研究进展》,简介如下:

激光显微切割(LMD)是一个从各种各样的组织样本中分离出特定的单细胞或的整个区域的组织的非接触式和无污染的方法。切割部分可用于进一步的基因组、转录组、蛋白质组学和其他下游的技术分析。

单细胞组学在生物医学中已经得到广泛的应用,由于植物细胞壁的特性,植物单细胞组学面临的首个技术难点在于如何分离单个细胞并保留空间位置信息。

徕卡以LMD为主结合Thunder和Aivia的组合方案,是优化植物单细胞组学工作流的高效工具,因为LMD能定义高细胞通量的纯原料并精确保留了细胞的空间信息。


wechat
欢迎扫码关注徕卡官方微信,更多显微技巧,行业资讯尽在掌握
close