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一文搞懂徕卡激光显微切割 (LMD) 研究里程碑:生物标志物发现篇

作者:Greb C, Marr J, SchlaudraffF

所属机构:Leica Microsystems CMS GmbH, Ernst-Leitz-Str. 17-37, 35578 Wetzlar, Germany.

1、研究目标

多数疾病的根源为细胞异常,而这类异常通常由蛋白质表达水平、丰度或生物活性改变所引发。


蛋白质是基因组功能的直接体现,细胞蛋白质组是判断机体健康状态、解析疾病机理的核心指标。即便在极小的空间范围内(如肿瘤微环境),相邻细胞的蛋白质组也会存在显著差异。想要解析这类复杂的生物系统,必须在蛋白质层面剖析细胞异质性。


研究目标:借助激光显微切割技术分离特定细胞群,实现高空间分辨率蛋白质组学分析,支撑后续深度的研究。

图 1:空间生物学技术路线(细胞 / 亚细胞表型→空间蛋白丰度→病理机制→生物标志物),空间解析对疾病研究的核心作用。

2、方法与材料

本研究核心采用深度视觉蛋白质组学(DVP) 技术,该技术由 Matthias Mann 团队研发,可精准标注具有空间特征的细胞表型。整套工作流整合两大核心技术:


1、激光微切割技术(LMD):实现空间分辨下的细胞分离;

2、超灵敏质谱技术:完成深度蛋白质组分析。

徕卡 LMD 是 DVP 的核心工具,可在无接触状态下分离单细胞或感兴趣区域(ROI)样本,避免邻近细胞信号干扰,实现完整组织切片内单细胞蛋白质组分析。



整套工作流程融合成像、AI 分割、激光显微切割、蛋白质组学分析四大环节:依靠人工智能自动识别特定表型细胞并标记,再通过 LMD 完成自动化分离,最终结合质谱技术获取分子层面研究数据。


图 2 :人工智能分割与激光微切割(LMD)联用,提升研究通量。AI 自动识别目标细胞并标记,LMD 自动化完成分离,大幅节约实验时间。

3、研究结果

深度视觉蛋白质组学(DVP)自 2022 年推出后,已从概念性技术突破发展为成熟的转化医学研究工具,各阶段重要里程碑如下:

2022 年代表研究:Mund 等人(《自然 - 生物技术》)

核心成果:正式推出 DVP,打造全球首个结合人工智能的空间单细胞蛋白质组学技术,完成组织切片单细胞蛋白质组图谱分析,解析细胞身份与异质性。

2023 年代表研究:Rosenberger 等人(《自然 - 方法》)

核心成果:技术升级为单细胞 DVP(scDVP),实现肝细胞蛋白质组空间分区图谱绘制;支持引导式感兴趣区域(ROI)结合 LMD 开展实验。


2024 年代表研究:Nordmann 等人(《自然》)

核心成果:实现临床转化突破,在致命性皮肤病中锁定 JAK-STAT 通路,确定 JAK 抑制剂为候选治疗药物;同期上线协作式 DVP 平台,支持多中心疾病机制研究。


2025 年代表研究:Rosenberger 等人(《自然》)、AACR 会议海报

核心成果:应用于遗传性 α1 - 抗胰蛋白酶缺乏症研究,绘制蛋白毒性应激图谱,阐明病理机制并提出贝特类药物治疗方案;推出自动化、可扩展的 AI 驱动 DVP 工作流,拓展制药领域应用场景。


综合结果表明,DVP 技术已完成从基础研究向临床应用的跨越,为精准医学领域的空间组学研究建立了标准工作流程。

4、技术核心价值与应用场景

激光显微切割(LMD)技术持续迭代,满足空间蛋白质组学对通量、精度的需求,主要优化及应用形式。


图 3a 说明:LMD 通量优化方案,切割后的样本可直接收集至孔板,显著提升实验整体通量。

图 3b 说明:感兴趣区域(ROI)的两种定义方式:一是依托人工智能图像分割划定区域;二是使用规则矩形手动划定区域,适配多样化实验需求。

结论

1、激光显微切割(LMD)可实现单细胞级别的生物样本精准分离,同时完整保留组织空间信息,适用于肿瘤微环境等异质性较强的生物结构,支持细胞级高分辨率分析。

2、深度视觉蛋白质组学(DVP)是一套集成化技术体系,整合高分辨率显微技术、AI 图像分割、无接触式激光显微切割、超灵敏质谱技术四大模块。

3、DVP 已成功应用于人类临床样本研究,能够有效挖掘疾病作用机制与可药物化靶点。目前该技术正持续推进系统化扩展与全流程自动化,逐步拓展至更多疾病研究领域。


补充信息:更多内容可查阅官网 www.omicvision.com


参考文献:

1. Andreas Mund, Fabian Coscia, Andras Kriston, et al. Deep Visual identity and heterogeneity. Nat Biotechnol, 2022, 40: 1231–1240. https://doi.org/10.1038/s41587-022-01302-5

2. Florian A. Rosenberger, Marvin Thielert, Maximilian Strauss, et al. 空间单细胞质谱技术定义了肝细胞蛋白质组的分区. Nat Methods, 2023, 20: 1530–1536. https://doi.org/10.1038/s41592-023-02007-6

3. Thierry M. Nordmann, Holly Anderton, Akito Hasegawa, et al. 空间蛋白质组学确定 JAKi 为一种致命皮肤病的治疗方法. Nature, 2024, 635: 1001–1009. https://doi.org/10.1038/s41586-024-08061-0

4. Florian A. Rosenberger, Sophia C. Mädler, et al. 深度视觉蛋白质组学绘制遗传性肝病中的蛋白毒性图谱. Nature, 2025. https://doi.org/10.1038/s41586-025-08885-4

5. Elias Maris, Farid Jahouh, Kathleen Allaerts, Rob Vreeken. 开发一种连续激光显微切割组织切片工作流,用于新鲜冷冻组织切片中药物的空间和定量分析. PLoS one, 2024. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0312542

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与传统激光显微切割系统不同,徕卡激光显微切割系统无需移动样品,而是通过移动激光、重力收集,大限度地避免样品污染,为您提供可即时分析的理想切割组织样品。 激光显微切割 (LMD,亦被称为激光捕获显微切割或LCM) 便于用户分离特定的单个细胞或整个组织区域。徕卡激光显微切割系统采用独特的激光设计和易用的动态软件,从整个组织区域到单个细胞,用户可以轻松分离目标区域(ROI)。 激光显微切割通常用于基因组学(DNA)、转录物组学(mRNA、miRNA)、蛋白质组学、代谢物组学,甚至下一代测序(NGS)。神经学、癌症研究、植物分析、法医学或气候研究人员均借助这种显微切割技术进行学科研究。此外,激光显微切割也是活细胞培养 (LCC) 的一款理想工具,可用于克隆、再培养、操作或下游分析。