多色共聚焦显微镜经常受到样本中荧光探针光谱重叠的限制。本文探讨了荧光团光谱分离中的常见挑战以及如何克服这些挑战,包括使用荧光寿命成像作为分离具有重叠光谱的荧光团的替代方法。
介绍
多色共聚焦显微镜是当今细胞生物学实验室中的一种基本技术。为了揭示生物系统的复杂性,需要能够同时分析样本中的多个结构、分子和微环境,并将它们相互关联。这可以通过使用不同颜色的荧光标记或生物传感器标记每个感兴趣的特征来实现,然后进行同时或顺序的多通道成像,以捕获每个探针在特定通道中的信号。然而,这种“多重化”方法的荧光染料数量是有限的。本文将深入探讨限制多色共聚焦显微镜多重化能力的一些挑战,以及改善荧光染料分离并增加可区分荧光探针数量的一些策略。
为什么多色共聚焦实验如此具有挑战性?
在多色共聚焦显微镜中,无法找到合适的荧光探针组合是一个常见的难题,这可能会显著延缓实验进展。导致这个问题的因素包括可用于光谱分离的荧光染料或荧光蛋白(FP)的可用性,以及共聚焦系统的限制,例如激发线、滤光片和探测器的数量和特异性。虽然有机荧光体的激发和发射峰通常在其最大高度的一半(FWHM)处宽度约为35纳米,但完整的光谱特征往往可以跨越几百纳米,包括肩部和长尾部(见图1)。考虑到可见光谱本身仅跨越约360纳米(从约380到740纳米),在多色实验中,特别是结合超过三种荧光体的实验中,光谱重叠几乎是不可避免的。光谱重叠可能导致严重的伪影,包括荧光团之间的不必要能量转移和一种荧光团的发射信号渗透到另一个荧光团的检测通道中(也称为光谱串扰或交叉)。此外,还可能遇到自发荧光和光毒性问题,这些问题使得在某些光谱区域激发染料变得不可行。
考虑一个四色实验,其中首选染料为Alexa488、Alexa546、Alexa568和TOT0-3(图1)。激发线必须仔细定位,以避免在每个通道中激发超过预期的染料。这可能会带来一些权衡,例如由于偏离峰值中心而导致某些物种的激发效率低下。更重要的是,发射曲线的强光谱重叠使得避免串扰伪影成为一项挑战。因此,很难判断在受影响的图像通道中,实际上是哪个荧光染料产生了你所看到的信